1978年，丹东师范高等专科学校成立，当年设立数学专业。

1985年，丹东师范高等专科学校增设地理、生物两个专业，分别成立地理系、生物系。

2003年，辽东学院成立，地理系、生物系归属于农业与环境学院，数学系归属于师范学院。设置资源环境与城乡规划管理地理类本科专业。

2004年，设置数学与应用数学本科专业。

2006年，农业与环境学院地理系、机电学院土木工程系、工商管理学院工程管理系整合成立城市建设学院。

2007年，设置生物技术本科专业。

2013年，根据教育部2012年新的本科专业目录，资源环境与城乡规划管理拆分为自然地理与资源环境、人文地理与城乡规划。

2018年，生物技术专业停止招生。

2019年，自然地理与资源环境专业停止招生。

2022年，城市建设学院与农学院分别申报备案地理科学（师范类）、生物科学（师范类）专业。

 2023年，为打造师范类理学特色专业群，学校成立理学院。师范学院的数学系、城市建设学院的地理系、农学院的生物系、化工与机械学院的大学物理教学部归属理学院。成立之初的理学院拥有数学与应用数学（师范类）、地理科学（师范类）、人文地理与城乡规划、生物科学（师范类）四个专业。并承担全校数学、物理、化学公共教学任务。